Meditsiinijäätmete purustajad jagunevad üldisteks meditsiinijäätmete purustajateks ja teravate jäätmete purustajateks. Üldisi meditsiinijäätmete purustajaid kasutatakse peamiselt tavaliste jäätmete, nagu plasti, paberi ja kanga töötlemiseks, samas kui teravate jäätmete purustajad on mõeldud spetsiaalselt teravate esemete, nagu nõelad ja terad, töötlemiseks. Nende terad ja hakkimiskambri materjalid on vastupidavamad, tagades ohutu purustamise ja vältides juhuslikke vigastusi.
Jõuallika järgi saab purustajad jagada elektrilisteks ja hüdraulilisteks purustajateks. Elektrilised purustajad kasutavad terade käitamiseks mootorit, mille tulemuseks on lihtne struktuur ja lihtne töö, mis sobib väikestele ja keskmise suurusega meditsiiniasutustele. Hüdraulilised purustajad kasutavad hüdraulilist süsteemi, et tagada suurem pöördemoment, mis sobib suure intensiivsusega ja suuremahuliste jäätmete töötlemise stsenaariumide jaoks, nagu suured haiglad ja tsentraliseeritud töötlemiskeskused.
Meditsiinijäätmete purustajaid saab liigitada ka käsitsi/poolautomaatseteks purustajateks ja täisautomaatseteks intelligentseteks purustajateks. Manuaal- või poolautomaatsed purustajad sobivad väikestesse asutustesse, mis vajavad söötmiseks ja tühjendamiseks käsitsi töötamist. Täisautomaatsetel intelligentsetel purustajatel on automaatne söötmine, automaatne purustamine, automaatne tühjendamine ja intelligentsed jälgimisfunktsioonid. Nad saavad automaatselt reguleerida hakkimiskiirust ja väljundosakeste suurust vastavalt jäätmeliigile, parandades töötlemise tõhusust ja tagades ohutuse.